氣調庫是在傳統冷藏庫的基礎上發展起來的，從表面上看它貌似冷藏庫，但在建筑結構和使用管理上與冷藏庫有著很大區別。主要表現在：
1、氣密性
氣密性是氣調庫的建筑要求區別于冷藏庫的一個主要特點。氣調庫要求圍護結構既要具有保溫隔熱，防潮，減少與外界的冷熱交換，還要求庫體墻壁四周、庫門以及所有進出口管線連接處嚴格密封，盡可能減少庫內外的氣體交換。只有這樣，才能人為的調節庫內氣體成分，減少或避免外界氣體對庫內氣體成分的干擾。
2、快進整出
水果進入氣調狀態的時間越短越好，氣調庫貯藏要求水果入庫速度快，以便盡快裝滿、封門和調氣。貯藏過程中盡可能減少開門次數。頻繁開門不僅影響貯藏效果、增加運行成本，還會降低庫門的氣密性。水果出庫時，為保證水果的貨架期，最好一次出完或在短期內分批出完。
3、安全性
由于氣調庫對圍護結構氣密性要求較嚴，故在降溫、調氣過程中，隨著庫內溫度、壓力的變化，會使圍護結構的兩側產生壓差，從而會破壞氣密層，甚至是圍護結構發生漲裂或塌陷。為了平衡和減小庫內外壓差，氣調庫必須設有安全閥和調氣袋，閉環運行的降氧機庫內壓力大這種情況應引起重視，開環運行的制氮降氧系統則無此問題擔憂。
4、滿庫貯藏
除留出必要的通風、檢查通道外，庫內水果應盡量高堆滿裝。一方面，由于庫內水果越多，庫內的孔隙相對越少，加之水果呼吸消耗氧氣，所以水果進入氣調狀態的時間越短；另一方面庫容積利用系數越大，制冷、調氣運行成本可有所下降。
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